Kolejnym reformatorem, który wystąpił ze swoimi tezami w Szwajcarii był wybitny humanista Jan Kalwin (1509- 1564), głosił on poglądy zbliżone do poglądów Marcina Lutra:
- oryginalność Jana Kalwina zawierała się w doktrynie o predestynacji, czyli o przeznaczeniu, według tej doktryny każdy człowiek z góry ,od Boga jest skazany na zbawienie lub potępienie. Sam człowiek nie ma wpływu na swój stan, nie ma pojęcia „wolna wola”,
- Bóg jest jedyny i wszechmocny,
- podobnie jak Lutra, Jan Kalwin uważał, że jedynym źródłem wiary jest Biblia, według jego wykładni,
- Kalwin odrzucał większość sakramentów z wyjątkiem chrztu i eucharystii pod dwiema postaciami, w której Jezus jest jedynie symbolem,
- popierał lichwę jako wyraz umiejętnego bogacenia się,
- Kalwin był przeciwnikiem zakonów i celibatu,
- głosił powszechne kapłaństwo wszystkich wiernych,
- nie uznawał autorytetu papieża, sukcesji apostołów i struktury hierarchicznej Kościoła,
- jako wspólnoty wiernych miały być tworzone tzw. zbory nie kościoły, opłacane z dobrowolnych składek wiernych,
- był przeciwnikiem kultu obrazów, rzeźb, relikwii oraz innych form życia religijnego jak np.: pielgrzymek, czy procesji,
- był podobnie jak Luter przeciwnikiem kultu Matki Bożej i świętych.
Jan Kalwin głosił podgląd jakoby bogacenie się było przejawem łaski bożej, a bieda przejawem jej braku, dlatego zyskał sobie poparcie wśród mieszczan. Doktryna kalwina przyspieszyła w Europie Zachodniej proces kształtowania się burżuazji.
W 1534 roku Jan Kalwin zrezygnował z zarządzania beneficjami kościelnymi na terenie Francji i porzucił łono Kościoła. W obawie przed prześladowaniami ze strony katolików w 1535 roku uciekł do Bazylei.
Nauka Jana Kalwina spowodowała rozwój tzw. kalwinizmu, który był jedną z najważniejszych doktryn religijnych protestantyzmu. Swoje korzenie w kalwinizmie mają następujące ruchy : purytanie występujący na terenie wielkiej Brytanii, hugenoci we Francji , anabaptyści oraz prezbiterianie z terenów Szkocji.
Topografia występowania zwolenników Jana Kalwina obejmuje następujące obszary:
- Związek Szwajcarski,
- Południowa Francja,
- Szkocja,
- Północno wschodnia Irlandia,
- Tereny Niderlandów,
- Tereny Małopolski,
- Litwa,
- Księstwo Siedmiogrodu,
- Królestwo Węgierskie.